フック woof_custom_filter_items_order は、フィルター要素の順序を変更する機能を提供し、フィルターキーの配列を渡します（フィルターセクションキーは、tab Structureの追加オプションをクリックすることで確認できます）

例：

add_filter('woof_custom_filter_items_order', function($order){    
    //your code here
    $order=['by_price','pa_color', 'by_text', 'product_cat', 'pa_size'];    
    return $order;
});